C’est l’ensemble des micro-organismes (surtout des bactéries) qui se trouvent dans le tube digestif, et pèsent environ 1,5 kg. Ils aident à digérer de nombreux aliments, comme la cellulose et les fibres, les sucres, le lactose, et un déséquilibre du microbiote intestinal pourrait favoriser le cancer colorectal.